Профили: «Ихтиология», «Аквакультура», «Управление водными биоресурсами и рыбоохрана».

Квалификация: Бакалавр.

Направление открыто в 1995 году на базе и СибрыбНИИпроекта (ФГУП "Госрыбцентр") для подготовки ихтиологов-рыбоводов. ГАУ Северного Зауралья является единственным вузом в Уральском и Сибирском регионах, который ведет подготовку по данному направлению. Преподаватели и студенты выполняют научные исследования по следующим направлениям: эколого-рыбохозяйственный мониторинг водоемов;совершенствование биотехники искусственного воспроизводства осетровых,сиговых и других видов рыб; изучение паразитофауны рыб; экологический мониторинг естественных водоемов. Имеется научная школа по рыбоводству, возглавляемая д.б.н., профессором, заслуженным работником рыбного хозяйства РФ И.С. Мухачевым. Развито экологическое направление, возглавляемое членом-корреспондентом Международной академии наук Экологии и Безопасности жизнедеятельности, к.б.н., профессором Л.В. Михайловой.