Агротехнологический институт создан 1999 году, на базе Агрономического факультета Сельскохозяйственного института существующего с 1959 года. Это стабильный институт Аграрного университета в научный и образовательный процесс, которого активно внедряются современные образовательные и информационные технологии.
Несмотря на солидный возраст, институт неизменно находится на ведущих позициях современной сельскохозяйственной науки и педагогики, обладает огромным потенциалам в деле подготовки профессиональных кадров для сельскохозяйственного производства Северного Зауралья и кадров высшей квалификации для научных учреждений региона.
Руководство институтом осуществляют:
В настоящее время ведется подготовка по следующим направлениям бакалавриата:
профиль «Агрономия»;
профиль «Агроэкология»;
профиль «Технология производства и переработки сельскохозяйственной продукции»;
профиль «Декоративное садоводство и ландшафтный дизайн»;
профиль «Природообустройство»;
профиль «Экология»;
профиль «Земельный кадастр»;
профиль «Кинология»;
магистратуры:
магистерская программа «Адаптивно-ландшафтные системы земледелия»
магистерская программа «Селекция полевых культур»
магистерская программа «Технология производства зерна целевого назначения»;
магистерская программа «Инновационные технологии в растениеводстве с использованием космических систем»;
магистерская программа «Декоративное садоводство и ландшафтный дизайн»;
магистерская программа «Рекультивация и охрана земель»;
магистерская программа «Землепользование: организация, оценка и управление;
магистерская программа «Управление ресурсами охотничьих животных».
В состав Агротехнологического института входят 9 кафедр:
Земледелия – заведующая кафедрой, кандидат сельскохозяйственных наук, доцент Рзаева Валентина Васильевна;
Биотехнологии и селекции в растениеводстве – заведующая кафедрой, доктор сельскохозяйственных наук, доцент Казак Анастасия Афонасьевна;
Почвоведения и агрохимии – заведующий кафедрой, доктор сельскохозяйственных наук, профессор Абрамов Николай Васильевич;
Землеустройства и кадастров – заведующая кафедрой, кандидат сельскохозяйственных наук, доцент Евтушкова Елена Павловна;
Общей биологии – заведующий кафедрой, доктор биологических наук, профессор Лящев Александр Анатольевич;
Общей химии – заведующий кафедрой, доктор биологических наук, профессор Комиссаров Игорь Дисанович;
Экологии и рационального природопользования – заведующая кафедрой, кандидат сельскохозяйственных наук, доцент Санникова Наталья Владиславовна;
Философии и социально-гуманитарных наук – заведующая кафедрой, кандидат педагогических наук, доцент Семенкова Светлана Николаевна;
Физической культуры – заведующий кафедрой, кандидат педагогических наук, доцент Семизоров Евгений Алексеевич.