Агротехнологический институт, сформированный на базе агрономического факультета, старейший в Тюменской государственной сельскохозяйственной академии.

В сентябре 1959 года на специальность «Агрономия» было принято 50 человек, из них 30% по направлениям из хозяйств области. Первые преподаватели – Мершалова А.Ф., Аржиловский А.Д., Ермилов Г.Б., Каретин Л.Н., Комиссаров И.Д., Виноградова А.И., Жарков Н.И. Всего на факультете было 3 кандидата наук, а в настоящее время в институте образовательную деятельность ведут 17 докторов наук и 48 кандидатов наук, остепененность кадров составляет 66%.

Большим событием в жизни агрономического факультета явилось решение Ученого Совета академии и приказ № 13 от 28 февраля 1996 г. об открытии новой специальности на агрономическом факультете – агроэкологии.

В 1999 году по решению Ученого Совета академии на базе этих двух факультетов был организован Агротехнологический институт (АТИ), размещенный в 5 учебном корпусе. Развиваясь, институт открыл ряд новых специальностей: сначала «Земельный кадастр», затем специальность «Технология производства и переработки с.-х. продукции, а в 2002 году была открыта специальность «Плодоовощеводство и виноградарство».

Сейчас Агротехнологический институт расположен в новом современном учебном корпусе №7, который располагает 6 лекционными залами с мультимедийными установками, каждая кафедра ведёт занятия в специализированных аудиториях для практических и лабораторных занятий. В корпусе размещен крупный Агробиотехнологический центр с современным лабораторным оборудованием. Для творчества и внеучебных занятий студентов институт располагает своим актовым залом.